More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1077 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 244 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 128 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  51.15 
 
 		 153 aa  95.1  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 		 167 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 		 291 aa  92.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 128 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 148 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  46.67 
 
 		 147 aa  89  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 124 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 144 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 130 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 132 aa  85.9  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  46.97 
 
 		 133 aa  85.5  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  47.5 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 132 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  45.26 
 
 		 570 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  44.63 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  35.07 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  41.79 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 134 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 132 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 130 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 130 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 132 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 132 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  34.81 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.86 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 137 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.86 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.86 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.86 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  37.86 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  38.69 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.86 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.59 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  36.51 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  37.59 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  42.52 
 
 		 145 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  32.52 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 133 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.14 
 
 		 135 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  36.96 
 
 		 132 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.42 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.69 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.69 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  30.6 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.69 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.69 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  36.17 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  38.85 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  36.89 
 
 		 473 aa  65.5  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  38.85 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  39.37 
 
 		 136 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  36.64 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  36.96 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  36.96 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  43.94 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.76 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.76 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.76 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  32.82 
 
 		 134 aa  62  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  33.33 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.53 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>