More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3053 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 128 aa  249  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  67.74 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  56.15 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  57.85 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 		 267 aa  116  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  49.58 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  49.23 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  49.56 
 
 		 206 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  56.25 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  52.54 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 132 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  51.15 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  47.29 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  50 
 
 		 570 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  52.46 
 
 		 153 aa  104  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  52.59 
 
 		 291 aa  100  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  50.41 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  46.88 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  47.86 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  48.12 
 
 		 170 aa  90.5  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 		 147 aa  87  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 244 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  42.4 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  35.83 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  34.35 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  42.75 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.83 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.83 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.83 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.83 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.5 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  38.97 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  41.41 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  39.1 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  39.1 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  37.8 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  38.89 
 
 		 314 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  37.69 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  37.69 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  38.89 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  41.53 
 
 		 302 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  38.58 
 
 		 313 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 334 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  38.81 
 
 		 318 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  38.1 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  38.1 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  38.58 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  38.1 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  37.3 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  40.34 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  40.34 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  35.11 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  38.1 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  46.73 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.01 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>