More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3001 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 134 aa  256  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  64.8 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  62.99 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  54.55 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  52.67 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 		 180 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  53.44 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.23 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  39.23 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.23 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.23 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  43.52 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.69 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  39.83 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  41.23 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  46.73 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.2 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 		 172 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  36.13 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  53.97 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  53.97 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  37.88 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  35.29 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  57.14 
 
 		 318 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  37.88 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  34.21 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  46.48 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 206 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.4 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  42.45 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  42.45 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>