More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1243 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 141 aa  276  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  82.44 
 
 		 141 aa  217  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  64.29 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  66.91 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  66.91 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  66.94 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  62.59 
 
 		 139 aa  177  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  44.57 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  43.52 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  39.45 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  33.59 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  40.91 
 
 		 473 aa  63.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  35.11 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  40.86 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  35.11 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  35.11 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  38.68 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  30.08 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  38.68 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  38.68 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  38.68 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  35.51 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  35.51 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  35.51 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 167 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 167 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.74 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  37.74 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1826  phosphohydrolase  32.69 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.74 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.74 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.74 
 
 		 345 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.84 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  36.45 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  51.79 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  51.79 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  51.79 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1681  mutT/nudix family protein  32.69 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000627508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1816  mutT/nudix family protein  32.69 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000181059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  38.68 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1662  MutT/Nudix family protein  31.73 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.824241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  38.16 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1861  mutT/nudix family protein  32.69 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01503e-50 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3516  phosphohydrolase  34.02 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  39.18 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>