152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2344 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  100 
 
 
159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  98.74 
 
 
159 aa  324  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  98.74 
 
 
159 aa  324  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  97.48 
 
 
159 aa  321  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  96.86 
 
 
159 aa  318  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  96.86 
 
 
159 aa  318  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  95.6 
 
 
159 aa  317  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  95.6 
 
 
160 aa  316  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  80.77 
 
 
159 aa  268  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.92 
 
 
157 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.92 
 
 
157 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.92 
 
 
157 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.92 
 
 
157 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  79.73 
 
 
157 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  62.84 
 
 
169 aa  208  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 
152 aa  175  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  53.02 
 
 
156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 
151 aa  154  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.68 
 
 
150 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  49.65 
 
 
156 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  50.74 
 
 
138 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  44.04 
 
 
116 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  34.81 
 
 
161 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  31.76 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
145 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  33.64 
 
 
139 aa  53.9  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  31.25 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
346 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  23.49 
 
 
214 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  23.49 
 
 
214 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.83 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.83 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  25.19 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
345 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  25.19 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  25.37 
 
 
363 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
345 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.14 
 
 
139 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  27 
 
 
144 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
137 aa  47.8  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 
142 aa  47.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
143 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
149 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  32.95 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  34.71 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  24.35 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  28.69 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  41.51 
 
 
325 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  29.51 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  35 
 
 
143 aa  44.3  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  33.33 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  25.24 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  23.39 
 
 
352 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  32.5 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  29.73 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  26.76 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  30.49 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  31 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>