96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1314 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 152 aa  312  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.03 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.03 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.03 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.03 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.7 
 
 		 157 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.7 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.35 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.35 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  51.35 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.02 
 
 		 157 aa  173  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.35 
 
 		 159 aa  173  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 159 aa  170  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  49.66 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  53.85 
 
 		 156 aa  153  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  49.31 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 151 aa  140  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  47.55 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  44.14 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  39.51 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 187 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  27.66 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  25.45 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  22.79 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  26.09 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  25 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  34.55 
 
 		 214 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  34.55 
 
 		 214 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0228  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  25.98 
 
 		 356 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  25.2 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  29.17 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  25.23 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  26.32 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 		 252 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  22.06 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  24.24 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 		 346 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  27.27 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  27.27 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  27.27 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 179 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  27.05 
 
 		 134 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  24.41 
 
 		 252 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 		 346 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  27.5 
 
 		 136 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 		 346 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 		 346 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 		 346 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  38.6 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  25.45 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  36.76 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  24.26 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.55 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  26.47 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  27.06 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.55 
 
 		 345 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  22.06 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  24.07 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.55 
 
 		 345 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 155 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>