100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0765 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  53.69 
 
 		 159 aa  163  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  53.69 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  53.69 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  53.69 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  53.69 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  53.02 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  48.3 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  48.3 
 
 		 157 aa  153  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 152 aa  153  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  48.3 
 
 		 157 aa  153  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  48.3 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  48.3 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  49.65 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  45.33 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  47.45 
 
 		 138 aa  133  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  39.24 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 187 aa  98.2  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  46.3 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  26.15 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.93 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  26.15 
 
 		 134 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  27.91 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  29.41 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  31.53 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  31.53 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  31.53 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.17 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  29.47 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  30.65 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  30.65 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 171 aa  43.9  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  37.5 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  29.69 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  27.12 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  28.83 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  23.84 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  29.75 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  25.64 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 		 151 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  22.79 
 
 		 143 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  27.5 
 
 		 137 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  28.83 
 
 		 151 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  25.84 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  31.17 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3735  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225323  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  28.74 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  27.19 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  25.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  31.78 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  32.35 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  32.35 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  29.41 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  27.47 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  36.23 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 148 aa  40.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>