142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01946 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  100 
 
 
159 aa  327  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  327  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  99.37 
 
 
159 aa  324  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  98.11 
 
 
159 aa  321  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  97.48 
 
 
159 aa  320  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  97.48 
 
 
160 aa  320  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  96.86 
 
 
159 aa  318  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  96.86 
 
 
159 aa  317  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  80.77 
 
 
159 aa  268  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.92 
 
 
157 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.92 
 
 
157 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.92 
 
 
157 aa  254  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.92 
 
 
157 aa  254  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  79.73 
 
 
157 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  62.84 
 
 
169 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
152 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  53.69 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 
151 aa  154  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  51.01 
 
 
150 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  48.95 
 
 
156 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  50.74 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  44.95 
 
 
116 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  36.25 
 
 
161 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  39.61 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
142 aa  87  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  32.21 
 
 
233 aa  63.9  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
141 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  34.58 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  24.7 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  24.7 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
346 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.83 
 
 
346 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.83 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
345 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
346 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
346 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.83 
 
 
346 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 
345 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.36 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.14 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
144 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
149 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  26.6 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  29.75 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  27.47 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  24.77 
 
 
363 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  41.51 
 
 
325 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.88 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
134 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  44.3  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  35 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
149 aa  43.9  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
153 aa  43.9  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  33.33 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  25.24 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  33.75 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  33.75 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  35 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  27.87 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  29.69 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  30.49 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 
147 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 
146 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
147 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  26.71 
 
 
384 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.63 
 
 
362 aa  42.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2023  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296194  normal  0.0882034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  40.82 
 
 
151 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>