111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35623 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  100 
 
 
233 aa  481  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  31.76 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  31.79 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  32.21 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  32.21 
 
 
159 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
160 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 
159 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  32.21 
 
 
159 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
159 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  31.08 
 
 
159 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  44.74 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  44.74 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
152 aa  58.5  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  45.95 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  31.08 
 
 
157 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  30.41 
 
 
157 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 
152 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  27.81 
 
 
169 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
142 aa  52.4  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  30.41 
 
 
157 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.71 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.71 
 
 
151 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 
151 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  30.61 
 
 
157 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  30.41 
 
 
157 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
139 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  27.27 
 
 
159 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  27.27 
 
 
159 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 
145 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  29.41 
 
 
156 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
171 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 
171 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  48.84 
 
 
163 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
137 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  39.02 
 
 
141 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
146 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
180 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 
158 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  46.51 
 
 
158 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
147 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  46.51 
 
 
158 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  46.51 
 
 
158 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  30 
 
 
149 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  38.16 
 
 
144 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
138 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
135 aa  45.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
171 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
154 aa  45.8  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.94 
 
 
355 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  30 
 
 
149 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
234 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.94 
 
 
349 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
179 aa  45.4  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
141 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.9 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
141 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  35.94 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  28.46 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  28.46 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
143 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
153 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  50 
 
 
143 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  31.33 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.13 
 
 
362 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
133 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
146 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  35.71 
 
 
150 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  28.72 
 
 
156 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  25 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
132 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
150 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
134 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  31.07 
 
 
137 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
144 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  26.77 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
140 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  42.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2431  MutT/Nudix family protein  35.63 
 
 
172 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000214023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 
252 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
167 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
154 aa  42.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>