128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2333 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2333  GDP-mannose mannosyl hydrolase  100 
 
 
157 aa  323  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.32489 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2289  GDP-mannose mannosyl hydrolase  98.09 
 
 
157 aa  318  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2447  GDP-mannose mannosyl hydrolase  97.45 
 
 
157 aa  317  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2340  GDP-mannose mannosyl hydrolase  97.45 
 
 
157 aa  317  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2232  GDP-mannose mannosyl hydrolase  97.45 
 
 
157 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  78.57 
 
 
159 aa  256  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  77.27 
 
 
159 aa  255  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.92 
 
 
159 aa  254  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  77.92 
 
 
159 aa  254  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.92 
 
 
159 aa  254  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1606  NUDIX hydrolase  78.15 
 
 
160 aa  253  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.27 
 
 
159 aa  253  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  77.27 
 
 
159 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2665  NUDIX hydrolase  74.68 
 
 
159 aa  245  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.523325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2966  gdp-mannose mannosyl hydrolase  62.66 
 
 
169 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000202187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1314  NUDIX hydrolase  51.7 
 
 
152 aa  174  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0813  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 
151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3872  putative GDP-mannose mannosyl hydrolase  52.35 
 
 
150 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0765  GDP-mannose mannosyl hydrolase  48.3 
 
 
156 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.449279  normal  0.229947 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1071  putative NUDIX hydrolase  51.75 
 
 
156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2478  NUDIX hydrolase  52.21 
 
 
138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78679  normal  0.863391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1795  GDP-mannose mannosyl hydrolase  46.43 
 
 
116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07251  hypothetical protein  35.44 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3174  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
187 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.79931  normal  0.153515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1218  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
142 aa  87.8  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35623  predicted protein  30.41 
 
 
233 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659171  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27190  predicted protein  31.08 
 
 
214 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94153  predicted protein  31.08 
 
 
214 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0183016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  30 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  31.52 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.24 
 
 
346 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  33.64 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.68 
 
 
346 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.68 
 
 
346 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.68 
 
 
346 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
140 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.68 
 
 
346 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.98 
 
 
345 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.98 
 
 
345 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.68 
 
 
346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2881  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.603249  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  28.69 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  40 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
231 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  40 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  40 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  40 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  40 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  40 
 
 
334 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  25.58 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  32.26 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
240 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  31.46 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  30.97 
 
 
313 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  27.78 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  40 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.22 
 
 
314 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1755  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0638574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  42 
 
 
142 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 
147 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 
147 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
135 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
143 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 
147 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
147 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
142 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  42.37 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  46.67 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  32.91 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  39.39 
 
 
139 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
165 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  46.67 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>