More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5104 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  88.41 
 
 
345 aa  634    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
345 aa  705    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  81.79 
 
 
346 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  81.79 
 
 
346 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  81.21 
 
 
346 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  81.5 
 
 
346 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  81.79 
 
 
346 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  81.5 
 
 
346 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  56.9 
 
 
351 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  49.71 
 
 
362 aa  333  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.27 
 
 
349 aa  322  5e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.23 
 
 
355 aa  317  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.27 
 
 
338 aa  311  7.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  44.87 
 
 
344 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  44.87 
 
 
344 aa  285  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5608  cytidyltransferase-like protein  43.59 
 
 
378 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.400356 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1837  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.09 
 
 
367 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  41.23 
 
 
348 aa  268  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4845  cytidyltransferase-like protein  40.75 
 
 
353 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  40.23 
 
 
355 aa  243  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0228  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.24 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  39.35 
 
 
342 aa  222  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  38 
 
 
358 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
165 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1324  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.82 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  38.03 
 
 
137 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
171 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
171 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 
236 aa  85.9  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
171 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
137 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  46.6 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1732  cytidyltransferase-like protein  39.56 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.301192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
251 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  40.91 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
240 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
229 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
154 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  40 
 
 
139 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
231 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
199 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
146 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
136 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
139 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.15 
 
 
163 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 
140 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
231 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
662 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  40 
 
 
144 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  44.04 
 
 
140 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  41.59 
 
 
224 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
140 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
134 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
237 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
136 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
219 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  30.56 
 
 
250 aa  62.8  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
162 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
153 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
233 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
135 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
212 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  32 
 
 
141 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
173 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
252 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
225 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
147 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  36.11 
 
 
232 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
237 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
243 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
130 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0576  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.29 
 
 
180 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0154  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
238 aa  60.1  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1231  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.57 
 
 
172 aa  59.7  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1092  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.71 
 
 
171 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.925806  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  37 
 
 
267 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1625  cytidyltransferase-like protein  36.47 
 
 
168 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0825  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.71 
 
 
171 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.518512  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0960  cytidyltransferase-like protein  32.58 
 
 
176 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0025996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
244 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>