274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5608 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5608  cytidyltransferase-like protein  100 
 
 
378 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.400356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  60.86 
 
 
344 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  61.14 
 
 
344 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  59.65 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4845  cytidyltransferase-like protein  55.62 
 
 
353 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  50.84 
 
 
355 aa  339  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  52.81 
 
 
358 aa  334  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.27 
 
 
346 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  43.59 
 
 
345 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.03 
 
 
338 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.86 
 
 
349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.11 
 
 
355 aa  269  7e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.93 
 
 
362 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  43.59 
 
 
345 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.13 
 
 
346 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.13 
 
 
346 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  43.14 
 
 
351 aa  258  8e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.56 
 
 
346 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.56 
 
 
346 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.56 
 
 
346 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  42.33 
 
 
342 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1837  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.43 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0228  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.84 
 
 
356 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1324  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.55 
 
 
311 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
165 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  35.33 
 
 
137 aa  80.9  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  44 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0606  NUDIX hydrolase  26.3 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  0.376937 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  27.08 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
273 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  44.55 
 
 
320 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
226 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
171 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1732  cytidyltransferase-like protein  27.44 
 
 
164 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.301192 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1231  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  32.53 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0861  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.59 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
171 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0834  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  32.94 
 
 
170 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
229 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2370  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  34.52 
 
 
170 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  32.43 
 
 
141 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  30.43 
 
 
163 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 
269 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0254  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  30.59 
 
 
172 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2823  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.37 
 
 
172 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2201  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  37.21 
 
 
168 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1582  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  39.02 
 
 
168 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
229 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  40 
 
 
229 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
248 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1647  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  37.93 
 
 
178 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.439426  hitchhiker  0.00326189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0898  cytidyltransferase-like protein  35 
 
 
175 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1037  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  33.73 
 
 
176 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
229 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0960  cytidyltransferase-like protein  24.42 
 
 
176 aa  61.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0025996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 
267 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0825  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  29.41 
 
 
171 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.518512  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
242 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  29.41 
 
 
171 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2915  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.29 
 
 
174 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  37.19 
 
 
232 aa  59.7  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
135 aa  59.7  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
137 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
252 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1092  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  29.41 
 
 
171 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.925806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
246 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0767  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000775395 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1019  ribosomal protein S27E  31.82 
 
 
168 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
132 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
134 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 
126 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0890  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  28.24 
 
 
172 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3200  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  32.94 
 
 
182 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1561  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  37.93 
 
 
177 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.503576  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1430  cytidyltransferase-like protein  29.52 
 
 
171 aa  57.4  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  34.52 
 
 
173 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0591  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  37.78 
 
 
178 aa  56.6  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  43.52 
 
 
153 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
184 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 
237 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
171 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  34.97 
 
 
224 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1731  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  33.73 
 
 
168 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  32 
 
 
144 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  58.14 
 
 
170 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
144 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2898  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.71 
 
 
185 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0794  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.67 
 
 
177 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
231 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
228 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0576  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.16 
 
 
180 aa  53.5  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>