More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1194 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  100 
 
 
126 aa  238  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  64.8 
 
 
134 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  61.9 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  55.83 
 
 
141 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  52.54 
 
 
473 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 
147 aa  91.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 
143 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 
180 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  45.63 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  45.63 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  45.63 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  45.16 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  46 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  46 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  46 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  40 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  45 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
200 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 
156 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
236 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
163 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.44 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  36.44 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.44 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.44 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
196 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
168 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.44 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  34.91 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 
293 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 
167 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.18 
 
 
156 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.59 
 
 
135 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
229 aa  60.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  38.94 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
184 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 
164 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  30.4 
 
 
164 aa  58.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 
164 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.96 
 
 
338 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 
229 aa  58.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  40 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
229 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
184 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.91 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>