More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0710 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  64.18 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  66.42 
 
 		 138 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  61.81 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  38.71 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  38.71 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.83 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.83 
 
 		 473 aa  65.1  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  33.59 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  33.59 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  31.3 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  33.06 
 
 		 565 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  50.82 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  32.79 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  32.79 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  35.63 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  32.79 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  31.09 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  47.54 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  50.88 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  41.03 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  37.39 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  41.03 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  26.05 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  46.15 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  41.03 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  34.48 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  29.5 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  31.15 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  31.2 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  34.13 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  24.64 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  36.62 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  35.4 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  39.77 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  35.4 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>