More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1466 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  61.81 
 
 		 154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  58.91 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  37.96 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  37.96 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 		 473 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  34.56 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  34.56 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 147 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 141 aa  66.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  33.82 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.71 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  26.56 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  26.56 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  43.42 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  25.78 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  31.03 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  37.93 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  36.29 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  37.93 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  46.58 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  37.93 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  32.26 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  34.68 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  34.68 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  43.21 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  41.18 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  41.18 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  41.18 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  30 
 
 		 360 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  35.07 
 
 		 347 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  35.2 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  30.47 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  35.14 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  30.47 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  30.47 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>