More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0357 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  99.26 
 
 
136 aa  273  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
136 aa  273  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  99.26 
 
 
136 aa  273  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  56.69 
 
 
158 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  52.03 
 
 
134 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  52.94 
 
 
149 aa  123  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  47.62 
 
 
137 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 
140 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  52.89 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  38.14 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  36.44 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  41.07 
 
 
337 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  40.52 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  41.38 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  40 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  38.54 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  45.92 
 
 
315 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 
334 aa  63.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  40 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.87 
 
 
314 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  37.07 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  40 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  35 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.87 
 
 
314 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  40.35 
 
 
313 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  39.47 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  37.61 
 
 
347 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  33.04 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.93 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  30.17 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  28.45 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  37.93 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  35.2 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  30.51 
 
 
207 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
174 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  45.07 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
188 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  37.4 
 
 
316 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
200 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  28.45 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
199 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  36.21 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
184 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>