More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2097 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 151 aa  289  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  86.58 
 
 		 151 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 		 167 aa  158  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  56.29 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  56.08 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  55.97 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  49.6 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 196 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 167 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 167 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  42.74 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  42.74 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  42.74 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  42.74 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  38.81 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  35.61 
 
 		 358 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  39.17 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  30.83 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  30.83 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  41.77 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  41.27 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 229 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  37.3 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  27.56 
 
 		 355 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.54 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.04 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  37 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.75 
 
 		 346 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.75 
 
 		 346 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  37.04 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 291 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  27.56 
 
 		 349 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  37.96 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  37.96 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.84 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.52 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 351 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35.25 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.95 
 
 		 346 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  37.96 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.95 
 
 		 346 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5608  cytidyltransferase-like protein  34.26 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.95 
 
 		 346 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.95 
 
 		 346 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  33.09 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  34.62 
 
 		 355 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>