More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5852 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  46.61 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  44.17 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 120 aa  100  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  44.04 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  48.42 
 
 		 203 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  49.14 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  39.47 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  44 
 
 		 758 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  38.83 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  35.42 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  30.17 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  35 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.7 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  29.31 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  29.69 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  29.31 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  29.31 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  33.33 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  34.34 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  26.36 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 238 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  26.36 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  26.32 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  37.96 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  31.86 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  34.26 
 
 		 337 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  26.36 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  26.36 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  26.36 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  46.81 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  41.27 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  26.36 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  38.96 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  42.86 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.18 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>