More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4812 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  100 
 
 
140 aa  280  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  93.57 
 
 
140 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  93.57 
 
 
140 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  92.14 
 
 
140 aa  260  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  86.43 
 
 
142 aa  243  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  85.71 
 
 
142 aa  241  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  79.03 
 
 
137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  63.79 
 
 
141 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  63.79 
 
 
141 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  62.93 
 
 
140 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  61.21 
 
 
141 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  62.93 
 
 
140 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  62.93 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  50 
 
 
158 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 
183 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  55.17 
 
 
132 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  55.65 
 
 
185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  55.65 
 
 
185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  54.78 
 
 
185 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  45.61 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  50.43 
 
 
135 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
146 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 
203 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 
132 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  46.96 
 
 
140 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 
165 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  52.73 
 
 
758 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  42.55 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  44 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  36.28 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  28 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  28 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
167 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
167 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
206 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 
303 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  40 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  31.36 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  31.36 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  32.81 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0519  NUDIX family hydrolase  29.31 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.259714  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10010  decapping enzyme Dcp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12420)  33.62 
 
 
825 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.43911 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  28.32 
 
 
208 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  27.19 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  29.51 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 
284 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  29.29 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
162 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  29.23 
 
 
524 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2415  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
173 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
147 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
251 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  34.91 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  33.65 
 
 
313 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  40.98 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  30.34 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  38.18 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  33.06 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
248 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  29.7 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
239 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>