More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5080 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 158 aa  303  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  69.33 
 
 		 272 aa  201  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  70.67 
 
 		 270 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  70.67 
 
 		 270 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  70.67 
 
 		 270 aa  200  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  69.33 
 
 		 282 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  73.43 
 
 		 174 aa  193  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  71.03 
 
 		 248 aa  191  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  64.56 
 
 		 302 aa  190  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  69.93 
 
 		 268 aa  190  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  71.74 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  64.79 
 
 		 141 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  68.79 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  59.71 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  56.29 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  54.29 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  54.11 
 
 		 205 aa  138  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  55.94 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  55.24 
 
 		 206 aa  134  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  53.38 
 
 		 258 aa  133  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  48.92 
 
 		 430 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 203 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  52.11 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 		 311 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 		 311 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 		 311 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  37.32 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  37.04 
 
 		 305 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  32.82 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  30.99 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.51 
 
 		 317 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 		 583 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  30.77 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  37.21 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  39.08 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 322 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  35.71 
 
 		 292 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  44.83 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  35.23 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  35.23 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  35.23 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  29.29 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  35.23 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 536 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  29.29 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.67 
 
 		 577 aa  52.4  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  40.23 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 296 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 136 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>