36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0401 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  100 
 
 		 758 aa  1441    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  56.07 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  57.01 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  57.01 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  56.07 
 
 		 185 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  52.68 
 
 		 140 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 140 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  50.89 
 
 		 140 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  50.89 
 
 		 140 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 142 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 142 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 140 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 140 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 		 141 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 		 141 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 141 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 122 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 137 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  38.33 
 
 		 158 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  42.86 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  47.78 
 
 		 135 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 146 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 203 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1871  hypothetical protein  79.71 
 
 		 132 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480576  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 		 140 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1964  hypothetical protein  78.26 
 
 		 138 aa  62  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.845922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 124 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 		 128 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  27.54 
 
 		 146 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 130 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 120 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 132 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 147 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 132 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>