More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2939 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  79.81 
 
 		 106 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  46.36 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  43.81 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  43.81 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  42.99 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  41.58 
 
 		 183 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 146 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  37.4 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 203 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  37.38 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  35.78 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  40 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  46.77 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  46.77 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  30.71 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  32 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  34.19 
 
 		 524 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  32 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  32 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.5 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  32 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  32.8 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  54.17 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  40 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  40 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  40 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  36.71 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50.91 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 291 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29.91 
 
 		 758 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  38.71 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2785  nucleoside triphosphatase YtkD  39.68 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  30.17 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  51.02 
 
 		 306 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  44.83 
 
 		 310 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  51.06 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  45.28 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3111  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  36.67 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  40.68 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.11 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.98 
 
 		 314 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40.98 
 
 		 314 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>