More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0433 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 140 aa  290  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  77.7 
 
 		 145 aa  214  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  42.22 
 
 		 424 aa  90.5  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 161 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  35.34 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  35.38 
 
 		 305 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 302 aa  77.4  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  36.3 
 
 		 317 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 272 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 237 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  36.89 
 
 		 292 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  40.83 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 268 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 303 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 270 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 310 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  34.38 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 322 aa  67.8  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 303 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 151 aa  67  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 182 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 		 536 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 314 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  31.01 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  32.82 
 
 		 336 aa  62  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 322 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  30.15 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.94 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 219 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 351 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  29.69 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  31.25 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 322 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  29.33 
 
 		 395 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  34.92 
 
 		 301 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  43.02 
 
 		 343 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 341 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 194 aa  57  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  34.29 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.82 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  37.35 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  29.6 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  27.41 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  29.55 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>