272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2138 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  100 
 
 
310 aa  630  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  78.6 
 
 
299 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  71.94 
 
 
311 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  71.29 
 
 
311 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  71.29 
 
 
311 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  70.17 
 
 
317 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  60 
 
 
302 aa  338  8e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  52.43 
 
 
315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  47.33 
 
 
305 aa  254  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 
301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  48.4 
 
 
314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  46.44 
 
 
315 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  43.86 
 
 
292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  40.89 
 
 
303 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  40.59 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
322 aa  189  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 
289 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
333 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  36.36 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  36.95 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.6 
 
 
308 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  36.68 
 
 
286 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  36.68 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
356 aa  136  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  36.26 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
322 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
333 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  35.42 
 
 
343 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  37.45 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  29.75 
 
 
398 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  43.12 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 
151 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  40.62 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
149 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
150 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 
143 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
158 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  32.17 
 
 
160 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
164 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
139 aa  62.8  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
137 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
216 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
147 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  42.02 
 
 
145 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
166 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
153 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
143 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
229 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  31.2 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
147 aa  59.7  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
130 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
138 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
153 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
147 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
174 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.61 
 
 
577 aa  57.8  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
153 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
140 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
583 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
126 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
146 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
139 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
182 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
158 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
145 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
182 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  31.82 
 
 
430 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
166 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
137 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  31 
 
 
205 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
142 aa  53.1  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
229 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
129 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.59 
 
 
139 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  33 
 
 
206 aa  52.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
237 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
158 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  28.43 
 
 
137 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
172 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  28.43 
 
 
137 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
144 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>