More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0844 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  100 
 
 
282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  86.91 
 
 
268 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  79.18 
 
 
270 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  78.44 
 
 
270 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  78.44 
 
 
270 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  81.12 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  75.68 
 
 
272 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  58.94 
 
 
302 aa  225  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  65.87 
 
 
169 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  65.36 
 
 
174 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  69.72 
 
 
158 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  68.84 
 
 
151 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  54.11 
 
 
182 aa  158  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 
174 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  61.94 
 
 
141 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 
166 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
206 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  52.05 
 
 
205 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 
158 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  49.32 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 
182 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  48.23 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  41.76 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  48.25 
 
 
160 aa  125  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 
164 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
142 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
149 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
143 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 
150 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
153 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
147 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
151 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  35.85 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
311 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  37.61 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
143 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
140 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
129 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
144 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
139 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  40 
 
 
150 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
208 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
180 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
137 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
143 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
139 aa  55.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  38.89 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
193 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
173 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
140 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
136 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
144 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
146 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
155 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 
149 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  41.67 
 
 
169 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
138 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
137 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
170 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  38.71 
 
 
424 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  27.2 
 
 
149 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
229 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
322 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
144 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
145 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
142 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
139 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  29.03 
 
 
153 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
146 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
154 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
137 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  28.91 
 
 
137 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  26.95 
 
 
153 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  29.03 
 
 
153 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  33.03 
 
 
137 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
139 aa  52.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  29.03 
 
 
153 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  33.03 
 
 
137 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  33.03 
 
 
137 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
179 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  41.89 
 
 
208 aa  52.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 
147 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  30.26 
 
 
149 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  31.3 
 
 
185 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  26.24 
 
 
153 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  29 
 
 
156 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
166 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>