More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4436 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 180 aa  360  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  56.28 
 
 		 216 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  71.32 
 
 		 211 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  70.87 
 
 		 322 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  70.59 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 310 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  36.19 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.19 
 
 		 317 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  36.94 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 322 aa  62  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 315 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  35.2 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  37.88 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  37.3 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  34.68 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  39.33 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 333 aa  54.3  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 281 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  24.8 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  40 
 
 		 258 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 430 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.46 
 
 		 315 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 302 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  35.9 
 
 		 325 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  29.46 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 341 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  35.29 
 
 		 308 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  35.11 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  32.98 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 322 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 		 536 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  32.65 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 139 aa  48.9  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 128 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  26.5 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 302 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  32.97 
 
 		 336 aa  48.5  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 229 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  45.45 
 
 		 329 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 326 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  33.08 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  45.45 
 
 		 329 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.57 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  36.96 
 
 		 343 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  27.17 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>