More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4208 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 174 aa  347  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  71.23 
 
 		 205 aa  214  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  73.61 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  68.49 
 
 		 206 aa  204  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  63.76 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  64.83 
 
 		 166 aa  193  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  64.83 
 
 		 203 aa  188  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  63.7 
 
 		 158 aa  185  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  63.01 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  60 
 
 		 430 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  62.07 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 		 174 aa  165  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  50.92 
 
 		 258 aa  164  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 282 aa  158  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  53.9 
 
 		 270 aa  157  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  53.9 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  53.9 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  49.71 
 
 		 268 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  53.75 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  50.57 
 
 		 248 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  53.16 
 
 		 302 aa  148  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 272 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  57.86 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  56.03 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 		 149 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 		 142 aa  95.9  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 140 aa  72  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.21 
 
 		 305 aa  67.4  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 		 583 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 299 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  36.36 
 
 		 325 aa  64.7  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  36.27 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 302 aa  60.8  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  33.79 
 
 		 424 aa  58.2  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  31.68 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  31.68 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  31.68 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  31.68 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  31.68 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  31.37 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 333 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 314 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3779  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 296 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  34.51 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  26.05 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 210 aa  52  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 136 aa  52  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 303 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  31.62 
 
 		 308 aa  51.2  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 252 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>