185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2543 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  75.53 
 
 		 205 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  65.43 
 
 		 182 aa  231  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  68.49 
 
 		 174 aa  204  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  67.55 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  69.06 
 
 		 158 aa  188  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  57.06 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  61.33 
 
 		 166 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  59.71 
 
 		 430 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  51.7 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  55.92 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  58.27 
 
 		 160 aa  158  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  52.69 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  52.69 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  52.69 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  52.1 
 
 		 268 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 		 282 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  52.05 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  54.79 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  54.29 
 
 		 169 aa  138  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  51.39 
 
 		 302 aa  138  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  55.24 
 
 		 158 aa  134  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  54.68 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  53.03 
 
 		 141 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 149 aa  99  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 150 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 147 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 151 aa  72  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  30.16 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  34 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 		 583 aa  56.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  36 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 351 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 141 aa  52.4  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 146 aa  51.6  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 139 aa  51.6  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  24.32 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 129 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 298 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 140 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 136 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  31.72 
 
 		 150 aa  49.3  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  26.56 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  25.64 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  32.67 
 
 		 137 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  32.67 
 
 		 137 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  32.67 
 
 		 137 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  32.67 
 
 		 137 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 333 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 161 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 		 159 aa  48.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 180 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  31.07 
 
 		 137 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 322 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  28.68 
 
 		 163 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  26.43 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  32.17 
 
 		 424 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 322 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 536 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.99 
 
 		 577 aa  47  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>