More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5398 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  100 
 
 
151 aa  295  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  68.79 
 
 
174 aa  189  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  63.92 
 
 
282 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  66.23 
 
 
270 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  66.23 
 
 
270 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  66.23 
 
 
270 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  67.61 
 
 
268 aa  184  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  65.49 
 
 
272 aa  181  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  68.89 
 
 
169 aa  181  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  68.79 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  66.9 
 
 
248 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  59.29 
 
 
302 aa  164  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  55.06 
 
 
174 aa  158  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  53.9 
 
 
166 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  57.45 
 
 
205 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  58.57 
 
 
141 aa  150  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  53.24 
 
 
182 aa  150  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  56.03 
 
 
182 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  52.52 
 
 
203 aa  143  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  54.68 
 
 
206 aa  144  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  52.32 
 
 
158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  53.52 
 
 
160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  51.03 
 
 
219 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  44.62 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  43.08 
 
 
258 aa  115  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 
164 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
149 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
140 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
311 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
311 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
311 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
310 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  40 
 
 
424 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  39.25 
 
 
317 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  37.84 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
180 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  35.34 
 
 
292 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
193 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
315 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
289 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
583 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
303 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
237 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
303 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
208 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  41.58 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
229 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
351 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
322 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  32.22 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
322 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
211 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  29.53 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 
296 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  34.09 
 
 
308 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.17 
 
 
315 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  37.86 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
216 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
216 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>