252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0237 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 		 237 aa  238  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2668  hypothetical protein  42.22 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  35.75 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 194 aa  93.6  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  34.25 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  30.94 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 310 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  35.11 
 
 		 315 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 130 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 130 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  26.5 
 
 		 134 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  31 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  25.55 
 
 		 322 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 142 aa  49.3  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  34.31 
 
 		 424 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 		 326 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 		 164 aa  48.9  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  28.87 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 145 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 161 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  29.66 
 
 		 141 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 		 311 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 143 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 		 311 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.18 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  35.9 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 333 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68309  predicted protein  34.95 
 
 		 927 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00286141 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  27.62 
 
 		 140 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  29.41 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  31.52 
 
 		 336 aa  46.6  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  25.78 
 
 		 169 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3018  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.27 
 
 		 175 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 180 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 153 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.31 
 
 		 163 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 170 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  30.33 
 
 		 149 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  29.41 
 
 		 142 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 152 aa  45.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.46 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  30.33 
 
 		 149 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  28.87 
 
 		 160 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  28.87 
 
 		 160 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  30.33 
 
 		 149 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  28.87 
 
 		 160 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  30.33 
 
 		 149 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 164 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 296 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  28.87 
 
 		 157 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 		 174 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 174 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 299 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  31.63 
 
 		 317 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 		 314 aa  45.1  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  28.93 
 
 		 158 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>