140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4995 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  100 
 
 
301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.07 
 
 
315 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 
289 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 
299 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.81 
 
 
317 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  39.48 
 
 
305 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  38.08 
 
 
311 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  38.08 
 
 
311 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  37.75 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
315 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
322 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
303 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
301 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  37.95 
 
 
325 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 
314 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  38.02 
 
 
314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 
303 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  33.44 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
286 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
324 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  33.58 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
333 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  34.89 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  32.09 
 
 
308 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  31.02 
 
 
343 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  27.44 
 
 
398 aa  99  9e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  29.82 
 
 
395 aa  89.7  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
150 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
216 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
138 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
139 aa  62.4  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
211 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.47 
 
 
577 aa  60.8  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
195 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
180 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 
237 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
322 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
166 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
140 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  34.75 
 
 
160 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
151 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  33.98 
 
 
146 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
143 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 
147 aa  53.9  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  26.12 
 
 
208 aa  52.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
144 aa  52.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
151 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
219 aa  52.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  38.82 
 
 
172 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  31 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
161 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
229 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
158 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
272 aa  49.3  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  27.84 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  28.67 
 
 
149 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
182 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  25.85 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
536 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
174 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  33.7 
 
 
128 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
139 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
169 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  38.2 
 
 
169 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.96 
 
 
134 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
182 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
164 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
174 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
145 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  37.7 
 
 
153 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  34.38 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  46 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
153 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
166 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
143 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
139 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
158 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  55 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0992  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
180 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  27.69 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
133 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  41.94 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>