More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1466 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  100 
 
 
237 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 
229 aa  238  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2668  hypothetical protein  42.54 
 
 
255 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  34.5 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
208 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
216 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
194 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  34.25 
 
 
208 aa  92  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
140 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
143 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
143 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
137 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
150 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
166 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  32.58 
 
 
305 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
322 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
140 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
145 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  32.03 
 
 
292 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  40.66 
 
 
301 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
311 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
311 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
151 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
311 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
144 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  36.17 
 
 
336 aa  58.5  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  40.45 
 
 
322 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 
195 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
324 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
149 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
140 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  32.76 
 
 
317 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
180 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  35.92 
 
 
424 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  37.66 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
315 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
146 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  35 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
150 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
137 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  32.81 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  38.24 
 
 
383 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  39.51 
 
 
139 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  38.57 
 
 
153 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  38.57 
 
 
153 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  38.57 
 
 
153 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  38.57 
 
 
153 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 
322 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  38.57 
 
 
153 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
302 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 
153 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 
164 aa  52.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
299 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
310 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
153 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
536 aa  52.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 
130 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
296 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 
130 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  45.61 
 
 
163 aa  51.6  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
149 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
134 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  40.62 
 
 
153 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
301 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 
153 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 
583 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
149 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
139 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
341 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  37.14 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  34.72 
 
 
435 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
155 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
143 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
139 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  27.12 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
135 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  29.47 
 
 
314 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  30.08 
 
 
325 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  40 
 
 
155 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
102 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  29.55 
 
 
135 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.55 
 
 
135 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
172 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.55 
 
 
135 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  38.57 
 
 
143 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>