More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 305 aa  620  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  55.59 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 310 aa  254  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  46.73 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  46.84 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.65 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  41.43 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 		 303 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  39.07 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  40.93 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  39.23 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  39.05 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  39.48 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  35.02 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 286 aa  148  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  32.47 
 
 		 395 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  31.87 
 
 		 343 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  27.54 
 
 		 398 aa  122  8e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 149 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 146 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  34.45 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  31.9 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  39.18 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  35.92 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  31.82 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 143 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.26 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  34.51 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  30.93 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  31.9 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  29.9 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  29.9 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  29.9 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  29.9 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 158 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 138 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.17 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  31.58 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  29.69 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>