More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7322 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 141 aa  277  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  64.79 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  59.15 
 
 		 272 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  59.86 
 
 		 302 aa  168  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  62.12 
 
 		 268 aa  167  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 		 270 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 		 270 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 		 270 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  64.39 
 
 		 248 aa  167  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  62.12 
 
 		 282 aa  167  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  65.38 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  62.59 
 
 		 174 aa  165  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  55.97 
 
 		 182 aa  156  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  55.22 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  56.03 
 
 		 174 aa  148  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  58.57 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 		 182 aa  143  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  53.73 
 
 		 203 aa  141  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  51.39 
 
 		 205 aa  136  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  53.03 
 
 		 206 aa  134  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 219 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  47.73 
 
 		 258 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  49.24 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  45.38 
 
 		 430 aa  116  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  35 
 
 		 424 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  39.6 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  37.11 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 		 583 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  26.9 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  33.61 
 
 		 292 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  32.33 
 
 		 308 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.64 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  33.06 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.61 
 
 		 577 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 536 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  39.36 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  28.68 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 310 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 322 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  32.73 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.3 
 
 		 315 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 231 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  38.3 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  38.3 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  40.43 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  40.43 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  40.43 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 240 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>