More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0059 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  100 
 
 		 258 aa  537  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  73.94 
 
 		 430 aa  306  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  55.92 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  51.7 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  50.92 
 
 		 174 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  57.25 
 
 		 182 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  56.62 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  56.62 
 
 		 166 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  52.52 
 
 		 219 aa  155  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  49.07 
 
 		 158 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 203 aa  148  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  49.31 
 
 		 160 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 		 158 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  47.48 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  52.31 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  47.06 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 141 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 151 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 149 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 150 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 147 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 142 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 143 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 164 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  31.9 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  34.31 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  29.41 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  31.78 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 161 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  27.21 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  35.71 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3779  mutT/nudix family protein  31.78 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  35.71 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  31.2 
 
 		 325 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  39.36 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  39.36 
 
 		 160 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  39.36 
 
 		 160 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 142 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 144 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  35.71 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 148 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  34.69 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 139 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.39 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 153 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  38.3 
 
 		 158 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 134 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 168 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 536 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 155 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 180 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  29.73 
 
 		 158 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>