190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0324 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  100 
 
 		 325 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 		 333 aa  322  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  52.16 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  41.69 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.75 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  39.07 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  40.46 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  37.42 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  39.79 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 289 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.76 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  38.22 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  37.95 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  35.41 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  37.46 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  33.44 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  31.51 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  30.08 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 137 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  31.2 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 147 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 138 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 146 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 129 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 153 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  32.39 
 
 		 160 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 142 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.77 
 
 		 205 aa  52.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 164 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 229 aa  52.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  28.99 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 174 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 134 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 180 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 155 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  36.84 
 
 		 430 aa  50.4  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 154 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 152 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 190 aa  49.7  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.51 
 
 		 170 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 219 aa  49.3  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 176 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 142 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 172 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 195 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  33.33 
 
 		 155 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  32.23 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.23 
 
 		 159 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  35.34 
 
 		 424 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  23.08 
 
 		 137 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  23.08 
 
 		 137 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  23.08 
 
 		 137 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  35.16 
 
 		 195 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 144 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  30.69 
 
 		 140 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  31.68 
 
 		 140 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  27.86 
 
 		 231 aa  46.2  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 194 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  48.78 
 
 		 172 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 182 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 195 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  23.08 
 
 		 137 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>