213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4224 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 302 aa  585  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  69.4 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  52.16 
 
 		 270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  57.55 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  57.55 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  57.6 
 
 		 282 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  57.95 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  67.79 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  66.9 
 
 		 158 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  61.59 
 
 		 174 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  66.67 
 
 		 169 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  59.86 
 
 		 141 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  53.47 
 
 		 182 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 		 166 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  53.16 
 
 		 174 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  52.98 
 
 		 205 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  59.29 
 
 		 151 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  51.39 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 		 182 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  49.31 
 
 		 203 aa  135  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  50 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 		 158 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 219 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  43.5 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  45.14 
 
 		 160 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 		 149 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 143 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 164 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  40.27 
 
 		 150 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 142 aa  84  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 140 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 151 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 		 583 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.68 
 
 		 577 aa  58.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 150 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 144 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 144 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 139 aa  55.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  36.89 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 147 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  34.69 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  39.8 
 
 		 424 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 138 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 140 aa  52.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 142 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 144 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 183 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 		 536 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 153 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 152 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 143 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 147 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 148 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 136 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 211 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 141 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 153 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 166 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  34.62 
 
 		 140 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.69 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.93 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 129 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 137 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 142 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 155 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  31.54 
 
 		 150 aa  47.4  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 137 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 139 aa  47  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 180 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 140 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>