201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4051 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  100 
 
 
315 aa  612  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  46.44 
 
 
310 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  48.17 
 
 
311 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  45.64 
 
 
301 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  48.17 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  48.17 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  44.05 
 
 
305 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
299 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  47.12 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  43.09 
 
 
317 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.41 
 
 
315 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  44.66 
 
 
292 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  39.87 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
303 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  41.22 
 
 
314 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
322 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  39.22 
 
 
301 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
351 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  40.93 
 
 
322 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  38.1 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
333 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  33.22 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  39.25 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
324 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  34.04 
 
 
395 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  33.22 
 
 
343 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
333 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  30.83 
 
 
398 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
149 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
158 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 
268 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
270 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
270 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
211 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  43.62 
 
 
248 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
153 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
322 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 
151 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
140 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
195 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
151 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
182 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
180 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  36 
 
 
216 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  35.48 
 
 
169 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
166 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
140 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.33 
 
 
159 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  30 
 
 
174 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  33.94 
 
 
160 aa  55.8  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
137 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
143 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
139 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.01 
 
 
577 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
138 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
174 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  32.86 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
229 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 
137 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.6 
 
 
170 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
146 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
147 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
129 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  36 
 
 
158 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34 
 
 
158 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 
190 aa  52.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
147 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.66 
 
 
158 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 
147 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  34.26 
 
 
141 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
148 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  50 
 
 
165 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.97 
 
 
583 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
172 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
142 aa  50.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
145 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
153 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
155 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
155 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
155 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
144 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  29.73 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
207 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.650531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>