194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3363 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  100 
 
 
219 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  60.31 
 
 
205 aa  217  8.999999999999998e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  59.47 
 
 
206 aa  211  7e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  58.08 
 
 
182 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  63.01 
 
 
174 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  48.21 
 
 
430 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  56.89 
 
 
182 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  59.24 
 
 
166 aa  174  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  59.86 
 
 
158 aa  171  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  56.25 
 
 
203 aa  168  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  52.52 
 
 
258 aa  156  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  52.8 
 
 
268 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 
282 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  55.78 
 
 
160 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
270 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
270 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
270 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  52.63 
 
 
248 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 
272 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 
158 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  52.7 
 
 
174 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
302 aa  134  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  48.95 
 
 
169 aa  131  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 
151 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 
141 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
142 aa  95.1  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
149 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
147 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
143 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
147 aa  72  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
137 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
146 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
322 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
140 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
138 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  31.3 
 
 
317 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
150 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
144 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.94 
 
 
315 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 
143 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 
139 aa  55.8  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
211 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
299 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
140 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
141 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
137 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
311 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
311 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
146 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
311 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
333 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
142 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
148 aa  52.4  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
129 aa  52.4  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
147 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  33.33 
 
 
424 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
144 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  28.68 
 
 
305 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  29.46 
 
 
301 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
228 aa  52  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
136 aa  51.6  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
303 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 
140 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
136 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
154 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
139 aa  50.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 
583 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
301 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
322 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
302 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
310 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
142 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  25.52 
 
 
140 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  29.12 
 
 
229 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
315 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
158 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  29.77 
 
 
325 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  32 
 
 
292 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
536 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
117 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 
139 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
140 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  29.85 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
142 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
140 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.67 
 
 
577 aa  46.2  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
163 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
145 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>