180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1152 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  76.82 
 
 		 289 aa  421  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  39.58 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  38.33 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  41.28 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.85 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.84 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  37.5 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  44.5 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  38.65 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  38.49 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  38.57 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  39.3 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  32.97 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.71 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 356 aa  95.9  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  31.74 
 
 		 395 aa  92  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  27.24 
 
 		 398 aa  91.7  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 139 aa  87  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 144 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  45.56 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 161 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.67 
 
 		 577 aa  57.4  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  45.57 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 166 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  31.25 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  30.37 
 
 		 141 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 146 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 140 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 129 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 194 aa  53.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 229 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  41.58 
 
 		 424 aa  53.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 174 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 		 583 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 158 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 237 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 139 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 142 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.63 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 		 160 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  40.74 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 143 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  27.42 
 
 		 142 aa  49.7  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 151 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 140 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 154 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 143 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 		 174 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 102 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 172 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 159 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  30.84 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 143 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>