110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5221 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  100 
 
 
333 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  54.84 
 
 
325 aa  322  8e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  50.5 
 
 
303 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  41.36 
 
 
292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  41.58 
 
 
303 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
299 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
310 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  37.54 
 
 
317 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
311 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
311 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
311 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.01 
 
 
315 aa  159  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  37.06 
 
 
305 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 
296 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  41.95 
 
 
289 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  35 
 
 
302 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  34.67 
 
 
308 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
315 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  35.46 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
314 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  37.15 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  33.22 
 
 
322 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 
333 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
324 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  31.66 
 
 
356 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  33.83 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  35 
 
 
286 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  34.39 
 
 
343 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  31.91 
 
 
395 aa  95.9  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  30.88 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
142 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
138 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
211 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
216 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
139 aa  59.7  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
195 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
164 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
149 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  32.03 
 
 
155 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
219 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
180 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
136 aa  53.5  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
174 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
322 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
182 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
142 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
140 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
154 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.06 
 
 
159 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
150 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
143 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  31.34 
 
 
203 aa  49.7  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
155 aa  49.7  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
142 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
174 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
206 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
153 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
139 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
229 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.61 
 
 
134 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
147 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
182 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.4 
 
 
158 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
237 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
162 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
166 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
154 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.82 
 
 
160 aa  46.6  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
158 aa  46.2  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
146 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 
161 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3288  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
180 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.549331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
145 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  34.67 
 
 
132 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
155 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  39.29 
 
 
142 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
166 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  28.91 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
154 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 
141 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3520  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
180 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
162 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 
208 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  33.62 
 
 
169 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  31.75 
 
 
149 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
132 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
165 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
155 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.98 
 
 
577 aa  43.9  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  32.71 
 
 
208 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  27.72 
 
 
164 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
160 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>