More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1264 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  100 
 
 
146 aa  283  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  58.45 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  52.59 
 
 
173 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  46.62 
 
 
158 aa  100  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 
282 aa  70.5  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.8 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 
229 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  28.03 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
153 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
228 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  28.03 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
298 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  31.5 
 
 
212 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
219 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
155 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
299 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
168 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
174 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  32.5 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  35 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.48 
 
 
345 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  36.44 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.97 
 
 
345 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  30.7 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
305 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
315 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.86 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  31.3 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  35.65 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
272 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1682  SH3-like region  30.83 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00241886  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
361 aa  53.9  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  34.75 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.87 
 
 
346 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  44.44 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
282 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  34.78 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
158 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  37.61 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  39.8 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  28.99 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 
346 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
270 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  34.78 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  39.8 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  39.8 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
188 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
270 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  28.99 
 
 
205 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  33.33 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  32.2 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
209 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.45 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
270 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.04 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  33.81 
 
 
203 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>