208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8260 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  100 
 
 
303 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  43.36 
 
 
292 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  42.12 
 
 
299 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  43.85 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  42.19 
 
 
314 aa  195  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  40.89 
 
 
310 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  41.69 
 
 
317 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 
311 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 
311 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 
311 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  48.64 
 
 
303 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  44.05 
 
 
305 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.13 
 
 
315 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  44.22 
 
 
326 aa  185  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
322 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
302 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  41.58 
 
 
333 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 
324 aa  175  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  41.12 
 
 
336 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
322 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
301 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 
286 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
351 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  38.53 
 
 
343 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  43.5 
 
 
289 aa  158  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  42.19 
 
 
308 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
333 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  38.54 
 
 
301 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  44.5 
 
 
296 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  33.72 
 
 
395 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  29.58 
 
 
398 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
211 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
195 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  40 
 
 
216 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
237 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
140 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
143 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
139 aa  67.4  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
139 aa  67  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
153 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
146 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
164 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
140 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
149 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
151 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
145 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
229 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  29.33 
 
 
231 aa  57  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
229 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
166 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  32.24 
 
 
160 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  31.06 
 
 
153 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
158 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
176 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
161 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  29.46 
 
 
153 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  37.39 
 
 
424 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
139 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.91 
 
 
577 aa  53.5  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  30.3 
 
 
153 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
143 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
150 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  29.55 
 
 
142 aa  52  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 
137 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
219 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
136 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
154 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
174 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
138 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10010  decapping enzyme Dcp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12420)  32.32 
 
 
825 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.43911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  32.35 
 
 
169 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
153 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  26.4 
 
 
151 aa  49.7  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  42.17 
 
 
172 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  31.03 
 
 
132 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  36.56 
 
 
158 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
141 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 
129 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
141 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 
102 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  46.34 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
136 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
219 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>