More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4880 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 117 aa  241  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  43.08 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  43.55 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  43.55 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  41.54 
 
 		 400 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 291 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  32.41 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  49.28 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  39.71 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  41.54 
 
 		 384 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  37.84 
 
 		 570 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.05 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40 
 
 		 384 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  36.17 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  33.77 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  62.5 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  62.5 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  40.32 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  66.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  66.67 
 
 		 179 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  53.19 
 
 		 318 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  66.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  66.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  66.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  65.62 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  66.67 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  39.71 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  34.94 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  66.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  66.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  48 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  67.74 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  65.62 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  66.67 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.86 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  42.03 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.86 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  66.67 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.86 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  65.62 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  66.67 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  45.1 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  64.52 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  47.62 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  67.86 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  56.1 
 
 		 329 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  56.1 
 
 		 329 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  47.62 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  60.61 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  64.52 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  47.62 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  36.67 
 
 		 396 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  36.36 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  47.62 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  66.67 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>