292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6519 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 		 200 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 		 184 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  36.81 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 174 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 441 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  40.97 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  40.69 
 
 		 205 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 341 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  36.67 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  38.62 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 456 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 347 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 347 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  35.57 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  34.03 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 337 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 337 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 337 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  26.57 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 525 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  43.62 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 383 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 298 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 299 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  24.34 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 		 361 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  52.83 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1697  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0101183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  37.11 
 
 		 310 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  34.92 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  35.29 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 305 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  51.22 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  39.06 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.81 
 
 		 316 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 240 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  35.44 
 
 		 314 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  31.03 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.57 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  27.48 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  61.76 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.48 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  47.92 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  40.35 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.57 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 129 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 133 aa  44.3  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 221 aa  44.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>