More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3815 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  100 
 
 
151 aa  317  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  53.79 
 
 
153 aa  170  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  50.35 
 
 
159 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  47.66 
 
 
137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  44.76 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  32 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  32 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
327 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
204 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 
169 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
172 aa  72  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
441 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
340 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  29.61 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 
347 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
456 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 
347 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_002978  WD1119  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.67 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  33.33 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01132  bifunctional thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase/ thiamin pyrophosphate hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  72.73 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  29.68 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  72.73 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  72.73 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01140  hypothetical protein  34.38 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1297  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2513  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00897802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1991  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1595  hydrolase, NUDIX family  34.38 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000876504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2469  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1254  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1312  hydrolase, NUDIX family  34.38 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.869507  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  29.8 
 
 
351 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
185 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  28.33 
 
 
145 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  30.28 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  30.28 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  40 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  31.3 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  29.58 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  34.18 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  32.43 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  41.94 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  41.94 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  29.58 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  34.18 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1314  NUDIX family hydrolase  29.52 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  34.18 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  29.52 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1336  NUDIX family hydrolase  29.52 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0415939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1352  NUDIX family hydrolase  29.52 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2131  NUDIX family hydrolase  30.69 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480915 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  34.65 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.33 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  39.66 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
230 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1647  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.654975  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  39.66 
 
 
145 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  41.82 
 
 
145 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
155 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  41.38 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  34.18 
 
 
145 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2155  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.028212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  41.38 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  25.69 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  25.69 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  41.38 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>