137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3417 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 341 aa  667    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  44.28 
 
 		 340 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  44.08 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  45.79 
 
 		 347 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 174 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  99.8  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 148 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 200 aa  89.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 		 184 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  37.14 
 
 		 179 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  56.02 
 
 		 170 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 159 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  41.83 
 
 		 204 aa  86.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  37.29 
 
 		 205 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  39.23 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  40.48 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  40.23 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  30.86 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  37.74 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 157 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  37.82 
 
 		 181 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  38.04 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  38.41 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  34.15 
 
 		 173 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 157 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  30.85 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  30.35 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  32.12 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  33.94 
 
 		 167 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  29.14 
 
 		 183 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  24.53 
 
 		 151 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  30.43 
 
 		 183 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  35.86 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 155 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  24.2 
 
 		 170 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 169 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  33.54 
 
 		 168 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 155 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  25.34 
 
 		 141 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  28.42 
 
 		 183 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  33.57 
 
 		 156 aa  49.3  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 156 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 169 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 163 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  43.04 
 
 		 160 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 156 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  35.9 
 
 		 180 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 155 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  28.02 
 
 		 184 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 155 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  43.04 
 
 		 160 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  43.04 
 
 		 160 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 155 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 141 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  41.54 
 
 		 167 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  35.92 
 
 		 148 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 153 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 441 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2559  NUDIX hydrolase  27.72 
 
 		 154 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.340623 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 155 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 155 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  38.16 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 153 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 156 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 149 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 168 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  33.33 
 
 		 158 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 142 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 169 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 142 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  35 
 
 		 149 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 		 148 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 174 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 147 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 151 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  28.72 
 
 		 183 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 179 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1984  hypothetical protein  36.25 
 
 		 181 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  hitchhiker  0.00979887 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>