248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1566 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  100 
 
 
183 aa  376  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  62.43 
 
 
183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  61.33 
 
 
183 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  59.36 
 
 
186 aa  226  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  58.6 
 
 
186 aa  223  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  58.7 
 
 
185 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  57.46 
 
 
183 aa  220  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  55.98 
 
 
184 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  54.6 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  48.9 
 
 
183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  51.4 
 
 
201 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  51.96 
 
 
201 aa  181  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  46.07 
 
 
181 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  48.35 
 
 
183 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  48.91 
 
 
184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  55.03 
 
 
185 aa  176  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  48.37 
 
 
192 aa  175  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  50.87 
 
 
188 aa  174  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  45.56 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  53.99 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  49.23 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  51.1 
 
 
199 aa  171  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  47.59 
 
 
186 aa  170  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  47.02 
 
 
184 aa  169  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  49.7 
 
 
182 aa  167  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  47.54 
 
 
188 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  49.71 
 
 
196 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  50.81 
 
 
187 aa  164  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  48.35 
 
 
182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  46.74 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  48.8 
 
 
184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  43.33 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  46.91 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  41.99 
 
 
184 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  48.62 
 
 
196 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  45.36 
 
 
185 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  48.28 
 
 
195 aa  158  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  47.65 
 
 
194 aa  158  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  50.9 
 
 
188 aa  157  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  48.85 
 
 
195 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  45.73 
 
 
180 aa  157  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  45.73 
 
 
180 aa  157  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  48.41 
 
 
189 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  47.9 
 
 
249 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  43.02 
 
 
182 aa  155  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  45.12 
 
 
180 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  44.25 
 
 
188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  42.56 
 
 
198 aa  154  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  49.11 
 
 
189 aa  154  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  42.78 
 
 
180 aa  154  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  42.05 
 
 
195 aa  153  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  153  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  42.26 
 
 
189 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  42.78 
 
 
180 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  46.91 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  46.91 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  44.85 
 
 
187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  46.3 
 
 
186 aa  150  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  41.05 
 
 
193 aa  150  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  40.98 
 
 
187 aa  150  8.999999999999999e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  44.31 
 
 
185 aa  150  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  45.86 
 
 
196 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  41.76 
 
 
190 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  43.02 
 
 
196 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  43.64 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  44.38 
 
 
190 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  37.88 
 
 
202 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  44.25 
 
 
196 aa  141  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  42.35 
 
 
197 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  47.43 
 
 
193 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  42.33 
 
 
186 aa  141  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  42.86 
 
 
181 aa  141  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  42.19 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  44.44 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  47.46 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  41.57 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  47.43 
 
 
193 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  42.19 
 
 
197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  45.45 
 
 
190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  42.59 
 
 
191 aa  137  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  39.9 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  42.51 
 
 
186 aa  136  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  43.52 
 
 
197 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  40.78 
 
 
192 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  41.21 
 
 
187 aa  135  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  42.53 
 
 
201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  38.74 
 
 
212 aa  134  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  38.33 
 
 
188 aa  134  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  41.34 
 
 
200 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  39.58 
 
 
215 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  40.62 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  41.36 
 
 
194 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  43.68 
 
 
202 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  44.1 
 
 
208 aa  131  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  39.47 
 
 
198 aa  131  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  37.22 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  38.62 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  42.94 
 
 
187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  39.88 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  38.73 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>