27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3061 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  333  9e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  47.78 
 
 		 225 aa  110  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  37.68 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  44.17 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  42.37 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  38.19 
 
 		 234 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  42.19 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  44.3 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  39.89 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  38.65 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1984  hypothetical protein  44.72 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  hitchhiker  0.00979887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  37.77 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 341 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  37.06 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  40.26 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  41.25 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  39.39 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  35.39 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  39.61 
 
 		 347 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 327 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  44.09 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 347 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 		 337 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 		 337 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 		 337 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>