24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1789 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  315  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  90.85 
 
 		 168 aa  280  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2408  hypothetical protein  50.94 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  42.11 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  38.67 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  37.35 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  39.86 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  35.12 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 340 aa  64.7  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  37.84 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  37.06 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 347 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  35.09 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 327 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 337 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 337 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 337 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  39.29 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 341 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  36.36 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  39.39 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  29.41 
 
 		 225 aa  41.6  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>